Os dados de uso e ocupação do solo em 2003 mostram que a região é extremamente alterada por usos humanos, que ocupam 73% do território, principalmente por campos antrópicos, que abrangem 51,6% de toda a área do Sistema Cantareira. Ao mesmo tempo, restam apenas 21% do território cobertos por vegetação remanescente da Mata Atlântica, em seus estágios inicial, médio e avançado de regeneração.
Expansão na região gera usos industriais e urbanos e a silvicultura.
Proprietários rurais vêm vendendo suas terras para especuladores imobiliários.
Ao mesmo tempo em que o uso do solo vem se modificando, a região enfrentou nos últimos anos, principalmente no período de 1998 a 2003, uma intensa estiagem.
o Sistema Cantareira atingiu o alarmante nível de quase 1% de armazenamento.
Em junho de 2007, 45% somente armazenamento, o mais baixo dos sistema produtor da RMSP.
